oquat

so: Sequence types and features ontology

This page summarize the different resources that reference so but use local unique identifiers that do not match the standard pattern of ^\d{7}$. Of the 13 resources, 1 variants on the standard prefix were found: [‘SO’].

bs: Biosapiens Protein Feature Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in bs. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:cb	19	SO:0000419, SO:0001070, SO:0001072, SO:0001073, SO:0001074, …
SO:ke	12	SO:0000409, SO:0000839, SO:0001146, SO:0100020, so/subsets/biosapiens#adjacent:to, …
SO:GAR	1	SO:0000839
SO:immuno_workshop	1	so/subsets/biosapiens#variant:of

clm: Cell Markers Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in clm. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:ke	3	SO:0000001, SO:0000110, SO:0001260
SO:immuno_workshop	1	SO:0000704
SO:cb	1	SO:0001411
SO:ma	1	SO:0005855

dpbo: DataPLANT Biology Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in dpbo. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:ke	3	SO:0000323, SO:0000327, SO:0000568

enm: eNanoMapper ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in enm.

external_xref	usages_count	usages
SO:cjm	1	uberon#spatially:disjoint:from

fbcv: FlyBase Controlled Vocabulary

Identifiers for this prefix are given incorrectly in fbcv. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:ma	1	FBcv:0003013

fypo: Fission Yeast Phenotype Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in fypo. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:1861	1	FYPO:0003251

geno: Genotype Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in geno. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:0000831 (gene member region)	1	GENO:0000666

hom: Homology Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in hom. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:non_functional_homolog_of	2	HOM:0000016, HOM:0000016
SO:similar_to	1	HOM:0000000
SO:homologous_to	1	HOM:0000007
SO:paralogous_to	1	HOM:0000011
SO:orthologous_to	1	HOM:0000017

icdo: International Classification of Diseases for Oncology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in icdo.

external_xref	usages_count	usages
SO:similar_to	1	RO:HOM0000000

nif

Identifiers for this prefix are given incorrectly in nif.

external_xref	usages_count	usages
SO:ke	893	SO:0000001, SO:0000002, SO:0000006, SO:0000013, SO:0000020, …
SO:xp	109	SO:0000078, SO:0000087, SO:0000088, SO:0000089, SO:0000090, …
SO:ma	76	SO:0000036, SO:0000037, SO:0000040, SO:0000042, SO:0000051, …
SO:cb	41	SO:0000059, SO:0000061, SO:0000419, SO:0000694, SO:0000836, …
SO:nlw	21	SO:0000708, SO:0000709, SO:0001464, SO:0001465, SO:0001466, …
SO:as	14	SO:0000140, SO:0000365, SO:0000367, SO:0000942, SO:0000943, …
SO:cjm	11	SO:0000162, SO:0000163, SO:0000164, SO:0000196, SO:0000197, …
SO:immuno_workshop	9	SO:0000704, SO:0001023, SO:0001024, SO:0001025, SO:0001026, …
SO:rd	7	SO:0000150, SO:0000307, SO:0000337, SO:0000339, SO:0000468, …
SO:vw	7	SO:0001794, SO:0001795, SO:0001796, SO:0001798, SO:0001799, …
SO:bm	6	SO:0001218, SO:0001483, SO:0001745, SO:0001746, SO:0001902, …
SO:ls	4	SO:0000007, SO:0000148, SO:0000149, SO:0000688
SO:regcreative	4	SO:0000167, SO:0000627, SO:0001055, SO:0001058
SO:ml	4	SO:0001668, SO:0001980, SO:0001981, SO:0001982
SO:ds	4	SO:0002329, SO:0002330, SO:0002331, SO:0002332
SO:andrewgibson	3	SO:0001915, SO:0001916, SO:0001917
SO:rtapella	3	SO:0001918, SO:0001919, SO:0001920
SO:non_functional_homolog_of	2	RO:HOM0000016, RO:HOM0000016
SO:jk	2	SO:0000931, SO:0000978
SO:chado	2	SO:0001416, SO:0001417
SO:jh	1	SO:0000552
SO:SG	1	SO:0000727
SO:GAR	1	SO:0000839
SO:jestill	1	SO:0001642
SO:db	1	SO:0001645
SO:AF	1	SO:0001658
SO:KE	1	SO:0001731
SO:mc	1	SO:0001740
SO:hd	1	SO:0001741
SO:BM	1	SO:0001744
SO:myl	1	SO:0001959
SO:rs	1	SO:0002049
SO:nrs	1	SO:0002095
SO:similar_to	1	RO:HOM0000000
SO:homologous_to	1	RO:HOM0000007
SO:paralogous_to	1	RO:HOM0000011
SO:orthologous_to	1	RO:HOM0000017

obci: Ontology for Biomarkers of Clinical Interest

Identifiers for this prefix are given incorrectly in obci.

external_xref	usages_count	usages
SO:immuno_workshop	2	SO:0000704, SO:0001025

ro: Relation Ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in ro. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:non_functional_homolog_of	2	RO:HOM0000016, RO:HOM0000016
SO:similar_to	1	RO:HOM0000000
SO:homologous_to	1	RO:HOM0000007
SO:paralogous_to	1	RO:HOM0000011
SO:orthologous_to	1	RO:HOM0000017

so: Sequence types and features ontology

Identifiers for this prefix are given incorrectly in so. See the GitHub repository.

external_xref	usages_count	usages
SO:ke	885	SO:0000001, SO:0000002, SO:0000006, SO:0000013, SO:0000020, …
SO:xp	109	SO:0000078, SO:0000087, SO:0000088, SO:0000089, SO:0000090, …
SO:ma	76	SO:0000036, SO:0000037, SO:0000040, SO:0000042, SO:0000051, …
SO:cb	41	SO:0000059, SO:0000061, SO:0000419, SO:0000694, SO:0000836, …
SO:nlw	21	SO:0000708, SO:0000709, SO:0001464, SO:0001465, SO:0001466, …
SO:as	14	SO:0000140, SO:0000365, SO:0000367, SO:0000942, SO:0000943, …
SO:cjm	11	SO:0000162, SO:0000163, SO:0000164, SO:0000196, SO:0000197, …
SO:immuno_workshop	8	SO:0000704, SO:0001023, SO:0001024, SO:0001025, SO:0001026, …
SO:rd	7	SO:0000150, SO:0000307, SO:0000337, SO:0000339, SO:0000468, …
SO:vw	7	SO:0001794, SO:0001795, SO:0001796, SO:0001798, SO:0001799, …
SO:bm	6	SO:0001218, SO:0001483, SO:0001745, SO:0001746, SO:0001902, …
SO:ls	4	SO:0000007, SO:0000148, SO:0000149, SO:0000688
SO:regcreative	4	SO:0000167, SO:0000627, SO:0001055, SO:0001058
SO:ml	4	SO:0001668, SO:0001980, SO:0001981, SO:0001982
SO:ds	4	SO:0002329, SO:0002330, SO:0002331, SO:0002332
SO:andrewgibson	3	SO:0001915, SO:0001916, SO:0001917
SO:rtapella	3	SO:0001918, SO:0001919, SO:0001920
SO:jk	2	SO:0000931, SO:0000978
SO:chado	2	SO:0001416, SO:0001417
SO:jh	1	SO:0000552
SO:SG	1	SO:0000727
SO:GAR	1	SO:0000839
SO:jestill	1	SO:0001642
SO:db	1	SO:0001645
SO:AF	1	SO:0001658
SO:KE	1	SO:0001731
SO:mc	1	SO:0001740
SO:hd	1	SO:0001741
SO:BM	1	SO:0001744
SO:myl	1	SO:0001959
SO:rs	1	SO:0002049
SO:nrs	1	SO:0002095

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